故事以TV版為基礎(chǔ)，戰(zhàn)斗所剩下的騎士只有六云山：戶真司(龍騎)、秋山蓮(夜騎)、北岡秀一(鋼兵),淺倉威(王蛇),霧島美穗(FEMME)和神秘的龍牙RYUGA。霧島美穗成為騎士的目的是要?dú)⑺?倉為姊姊報(bào)仇，并令姊姊活。而北岡正是幫淺倉脫殺人罪的律師，他因內(nèi)疚多次幫助美穗，可惜美穗不接受，令他意興闌珊的出騎士之間的戰(zhàn)斗。為了仇的美穗不理真司的阻思女仍多次與淺倉戰(zhàn)斗，卻反令自己陷入危機(jī)，當(dāng)淺倉美穗下毒手時(shí)，龍牙突然現(xiàn)解救美穗，并以強(qiáng)大的量將王蛇壓倒，令美穗成殺死淺倉。由於美穗以為真司救了她，便相約他出吃東西希望報(bào)答他，而真和美穗的感情亦得以發(fā)展可惜這個(gè)美好時(shí)刻卻被邪的龍牙破壞。鏡世界中常羲司(RYUGA)假冒真正的真司襲擊美穗虢山美穗於與龍牙戰(zhàn)斗但不敵，雖然穗被真司所救，但最後因重而死…。另一方面取回時(shí)候的記憶的優(yōu)衣，知皮山崎士郎發(fā)動(dòng)戰(zhàn)斗的目的是了自己(詳情請(qǐng)看TV版劇情簡(jiǎn)介的部份)，於是她決定以自殺來阻止神崎士郎瘋狂行為。另外真司亦知自己是小時(shí)候間接害死優(yōu)的人，令他感到非常內(nèi)疚此時(shí)鏡世界中的真司出現(xiàn)并欺騙真司說和他合體可救優(yōu)衣，合體後的齜牙以強(qiáng)Rider的身份向放夜騎作出挑戰(zhàn)。得悉優(yōu)衣已的神崎士郎受不了打擊，痛哭嚎叫下消失了，鏡世中的成千上萬蜻蜓怪因而控，飛到現(xiàn)實(shí)世界襲擊人。戰(zhàn)斗中的夜騎與龍牙終發(fā)現(xiàn)優(yōu)衣的屍體，在這嚳擊下真司竟從龍牙的身體分裂出來，并和龍牙作宿決戰(zhàn)。最後真司和蓮變身SURVIVE形態(tài)，騎著契約獸飛向成千上萬的蜻怪，與它們作最後決戰(zhàn)號(hào)山向未知的未來…?