故事以TV版為基礎戰(zhàn)斗所剩的騎士只六人：城真司(龍騎)、秋山蓮(夜騎)、北岡秀一(鋼兵),淺倉威(王蛇),霧島美穗(FEMME)和神秘的龍牙RYUGA。霧島美穗為騎士的的是要殺淺倉為姊報仇，并姊姊復活而北岡正幫淺倉脫殺人罪的師，他因疚而多次助美穗，惜美穗并接受，令意興闌珊退出騎士間的戰(zhàn)斗為了報仇美穗不理司的阻止仍多次與倉戰(zhàn)斗，反而令自陷入危機當淺倉向穗下毒手，龍牙突出現(xiàn)解救穗，并以大的力量王蛇壓倒令美穗成殺死淺倉由於美穗為是真司了她，便約他出來東西希望答他，而司和美穗感情亦得發(fā)展，可這個美好刻卻被邪的龍牙破。鏡世界的真司(RYUGA)假冒真正真司襲擊穗，美穗是與龍牙斗但不敵雖然美穗真司所救但最後因重而死…另一方面回小時候記憶的優(yōu)，知道神士郎發(fā)動斗的目的為了自己(詳情請看TV版劇情簡介的部份)，於是她定以自殺阻止神崎郎的瘋狂為。另外司亦知道己是小時間接害死衣的人，他感到非內(nèi)疚。此鏡世界中真司出現(xiàn)并欺騙真說和他合可拯救優(yōu)，合體後齜牙以最Rider的身份向夜騎作出戰(zhàn)。得悉衣已死的崎士郎受了打擊，痛哭嚎叫消失了，世界中的千上萬蜻怪因而失，飛到現(xiàn)世界襲擊類。戰(zhàn)斗的夜騎與牙終於發(fā)優(yōu)衣的屍，在這個擊下真司從龍牙的體中分裂來，并和牙作宿命戰(zhàn)。最後司和蓮變成SURVIVE形態(tài)，騎著契獸飛向成上萬的蜻怪，與它作最後決，走向未的未來…