為了給最疼愛的小老弟鳥（克里斯多夫·奈茨 Christopher Knights 配音）慶生，老大（湯?碧山格拉思 Tom McGrath 配音）帶領(lǐng)菜鳥以及好搭檔科斯季厘（里斯·米勒 Chris Miller 配音）、瑞哥闖入了防擁有最嚴(yán)的美國黃金儲備中心，為找到金庫盡頭僅有的臺銷售炸薯?xiàng)l的自動販機(jī)。誰知他們剛剛完成務(wù)沒多久，便被長著觸的販賣機(jī)吞了進(jìn)去，隨被運(yùn)到一個(gè)神秘的所在在全封閉的設(shè)施內(nèi)，四企鵝見到了偽裝成基因傳科學(xué)家的章魚戴夫（翰·馬爾科維奇 John Malkovich 配音）。原來戴夫曾是動物園一只明星少山魚，隨著萌態(tài)十足的企鵝們到來，他便跌入了絕望深谷。因此戴夫潛心研了可怕的血清，發(fā)誓要所有他曾待過的動物園的企鵝展開報(bào)復(fù)。老大伙伴們在逃亡途中得到風(fēng)特工隊(duì)的救助，而他和這些高傲的特工隊(duì)員分別阻止戴夫的陰謀…